1956年6月成立的云南省玉溪农业学校，原校址坐落于玉溪州城红塔山;
1963年因国家经济困难，学校停办;
1966年玉溪地委、行署决定将学校改名为"玉溪农林学校"，开设农学、植保两个专业;
1966年将学校迁至玉溪市研和镇向家庄;
1969年学校再次停办。
1970年玉溪地区革委会将地区直属学校合并为"玉溪地区五七中学"，玉溪农业学校为四分校，开办农学专 业"社来社去"一年制短期培训班;
1973年学校再一次停办。
1974年更名云南省玉溪农业学校;
1992年经省人民-批准，玉溪农业学校增挂"云南省玉溪烟草栽培学校"牌子，实行"两块牌子，一套 班子"的管理体制。
1993年，被省-认定为"省部级重点中专学校"，同年省-批准建立"云南省玉溪烟草栽培学校"(合署);
2000年，被首批认定为-重点中专;
2002年3月22日，升格为玉溪农业职业技术学校。
2005年7月，玉溪市委、市-以玉溪农业职业技术学校为"龙头"成立了玉溪烟草职业教育集团。
玉溪农业职业技术学校（以下简称“学校”）的前身是始建于1956年的玉溪农业学校。多年来，学校始终坚持党的--，落实立德树人根本任务，围绕职业教育高质量发展的目标，坚守兴农初心，发挥专业优势与资源条件，为云岭大地高原特色农业发展培养了一批批高素质技术技能人才。曾获全国“十佳”科技志愿者服务队、云南省现代学徒制试点学校、云南省民族团结进步教育示范学校、云南省职业培训鉴定“双十佳”先进单位、云南省众创空间、云南省@大学生创新创业示范基地、云南省高校-党建示范党支部、云南省高等学校教育科研先进集体、云南省高等学校教学管理先进集体、云南省高校毕业生就业创业工作质量提升奖等称号。
建校以来，经历了三易校址，三次停办，一次合并的曲折历程。1966年，更名为玉溪农林学校。1974年，恢复为云南省玉溪农业学校。1992年，加挂“云南省玉溪烟草栽培学校”牌子，实行“一个机构，两块牌子”的管理体制。2002年，经省教育厅批准、国家教育部备案，独立升格为专科办学层次的国家全日制高等职业院校。2005年，牵头组建玉溪烟草职业教育集团；2016年，牵头组建玉溪现代农业职业教育集团；2021年，入选全国第二批示范性职业教育集团（联盟）培育单位。2022年，入选云南省高水平专业群建设单位。
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